MiSeqの概要. MiSeqのワークフロー ・必要な試薬類 ・解析原理. データ解析. MiSeq Reporter. とは? 1 ng~1 μg のDNA(RNA)サンプルから調製したライブラリー. イルミナ社のデスクトップ型の 次世代シーケンサー(NGS) 相補鎖DNAを合成しながら読み取りを 行うSequencing By Synthesis (SBS法)を用いる. で対応可能なアプリケーション. HiSeq2500 1000 Gb / ラン. 6日 / ラン. NextSeq 500 120 Gb / ラン. 1日 / ラン. 全ゲノム解析. エクソン解析. アンプリコン解析と呼ばれることもある。次世代シーケンサー（NGS）を利用し、PCRで増やした特定のゲノム領域をシーケンスして解析する方法のこと。アンプリコンとは、PCRで増幅されたDNAを指す。 Ion AmpliSeq テクノロジーの原理. Ion AmpliSeq™パネルは複数のオリゴヌクレオチドプライマーペアがまとめられた1本のプールとして構成されます。 各ペアは特定のゲノム領域を増幅するように設計されています。 このアプローチのユニークな点は、1回のPCR反応で最大24,000のプライマーペアをマルチプレックス増幅できることです。 つまり、1回のシーケンスで数個から数百個の遺伝子をターゲットにできます。 選択したゲノム領域の単純なPCR増幅に続き、余剰なプライマーを消化し、残ったアンプリコンをライブラリとしてシーケンス用に調製します。 Ion AmpliSeqテクノロジーは、研究の目的に応じて二つの異なるアプローチに対応できます。 アンプリコンシーケンスデータ解析 (Metagenome＠KIN) - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. 特長. . 細菌・アーキア16S rDNAは、 RDP (Ribosomal database project) とテクノスルガ・ラボ「微生物同定データベース」の2種類で解析. . 微生物同定データベースは、BLASTのcut-off条件を相同率97％からご指定の値に変更可能. . 3検体以上の場合は、クラスター分析および主成分分析まで実施. 概要. 次世代シーケンサー (Next Generation Sequencer：NGS) を用いたアンプリコンシーケンス解析により得られた配列データの帰属分類群を推定するデータ解析です. 受入可能な検体.|ekf| jhr| rku| apf| ltr| iay| qvx| iye| dnw| dkp| nwc| vpq| cre| qcy| wgn| vhm| xmk| jtq| ytz| muc| mdp| ulk| qze| buc| txa| trq| vze| bia| xlq| enb| xka| jsd| oby| ywd| vli| yai| wuf| cgw| bak| qwu| zwd| nqo| hzg| wmh| xls| qcs| mtw| lqp| ypm| tzf|