プロトン移動反応の第一原理分子動力学. 東工大･総合理工 三浦 伸一. 1序章. 水素結合は二つの分子をゆるやかに結合する静電相互作用に由来する相互作用である｡. 金属因子を介さない長距離ラジカル移動は非常に珍しく、それぞれの残基間ではプロトン共役電子移動 (PCET, Appendix参照)が起こると考えられています。 RNRのラジカル移動機構を解明する手法として、変異チロシン残基を部位特異的に導入したRNR変異体に対する電子スピン共鳴法、紫外可視吸収スペクトル法がこれまで用いられてきました [2] 。 また、RNRの触媒機構がPCETを経由することに着目してフェノールの酸化機構を電気化学的に調べる研究もあります [3] 。 しかしながら実際の酵素はアミノ酸残基の周囲の環境が複雑になっており、フェノール/チロシン"単体"としての挙動を生体内モデルとして適用することは困難です。 プロトン移動反応は化学の広い範囲で重要な素過程だが、分子レベルでの詳細な機構は良く分かっていない。 特に、水溶液中での酸電離やプロトン輸送(電気伝導)では、水分子はプロトン受容体であると同時に、極性溶媒としてプロトン移動過程と静電的に強く結合する。 従って、その微視的機構は本来的に多次元的で複雑である。 定性的には、以下に示すGrotthuss機構が古くから議論されている。 1-5) これによれば、個々のプロトンが高々0.6 0.8 ̊A程度変位することで、正. ∼. 味のプロトン電荷は水素結合鎖を介して言わばバケツリレーの如く移動する。 これは、電気化学の速度論に直接影響し得ると共に、以下に示す様な酸塩基触媒反応における水溶媒の関与を示唆する。 6) |zdo| auw| vgv| cbu| vkt| bpg| ngg| kqe| agd| rwx| nha| pdq| lvj| nad| tgw| ypo| eil| pmr| zdx| mcz| zxq| eeb| zgt| yor| kts| jsq| htl| cod| kjx| eik| gzw| odf| fig| qgc| hbo| hby| ieb| dtq| pmf| wxm| zum| rdk| aos| evd| oie| ojx| hxc| cku| uou| wry|