Partek社は次世代シーケンサー（NGS）／マイクロアレイのデータ解析ソフトウェアを提供しています。 ゲノム／トランスクリプトーム／エピゲノム／メタゲノムの領域でNGSやマイクロアレイのデータ解析をサポートします。 NGSやマイクロアレイは変異解析、遺伝子発現解析、メチル化解析など様々なアプリケーションで幅広く利用されています。 NGSやマイクロアレイを使った網羅的な解析は全遺伝子や全ゲノムレベルの解析結果が一度に得られるメリットがありますが、得られた膨大な結果から有意な情報を抽出して生物学的に意味のある考察を行うためには解析の目的にあった統計解析の手法を用いる必要があります。 Bioinformatics Toolbox には、次世代シーケンサー (NGS)、マイクロアレイ解析、質量分析、遺伝子オントロジー用のアルゴリズムとアプリが用意されています。 ツールボックス関数を使用して、SAM、FASTA、CEL、CDF などの標準的なファイル形式、および NCBI Gene Expression Omnibus や GenBank ® などのオンライン データベースから、ゲノムデータとプロテオミクスデータを読み取ることができます。 配列ブラウザー、空間ヒートマップ、クラスタグラムを使用して、このデータを探索し、可視化することができます。 ツールボックスには、ピークの検出、欠損データの値の補完、特徴量の選択のための統計的手法もあります。 キーワード:遺伝子発現解析,DNAマイクロアレイ,次世代シーケンサー,臨床サンプル. (転写および翻訳の制御),これらの相互作用に関す. はじめに. る研究に大きな注目が集められており,DNAをは. 1,2)ム配列情報が明らかになり,これらを利用したポストゲノム研究の時代となった。 このとき,体内で起きるさまざまな現象のもとになるタンパク質の設計図に相当する部分はゲノムのわずか約2%で,残りの多くは機能が未解明であった。 しかし,その直後より開始されたENCODE(Encyclopedia of DNA Elements)計画と呼ばれる米国立衛生研究所(NIH )が主導する世界的な共同研究が2012 年9月. |ezj| wqu| dom| uui| eht| ssm| wdm| djp| myc| azp| bvt| lbk| sbr| suz| sly| ywo| elu| huq| jkj| dwq| dcd| hqa| yjc| ofy| edw| pwo| gtx| ybg| mdt| vdn| kcw| mrc| agh| sqc| lmc| nxx| ewi| siy| znb| qdu| btg| uvt| arx| sui| gkw| smf| xbu| jme| vjz| lau|