IIBMP2020 セッション3-2 森宙史(NIG)「メタゲノム解析」(3)ショットガンメタゲノム解析

アンプ リコン 解析 と は

遺伝子検査:ある生物種に固有の塩基配列(遺伝子)を検出する検査法。. 検出技術としては、PCR法など がよく用いられる。. 培養法に比べ、迅速に結果が得られ、検出感度が高いことが特長として 挙げられる。. インターカレーター法:リアルタイムPCR における 比較は、 組成データ解析(Compositional data analysis:CoDA) によって行われる。 各解析の概要. Taxonomy analysis. 16S rDNA のアンプリコンシーケンスをデータベース上の細菌に照合させる分析。 どのような細菌が存在するのかを明らかにする。 PICRUSt2 analysis. 群集中の細菌がコードしている酵素の存在量を予測する解析。 専用ツールの PICRUSt2 はデフォルトの Qiime2 にはインストールされないため、 別個にプラグインする必要がある。 ただし、最新版の Qiime2 には対応していないことがあるため、本稿では 2019.7 版をインストールしている。 Differential analysis. 環境 アンプリコンシーケンス解析 - TechnoSuruga Laboratory Co.,Ltd. 環境関連 群集構造解析. 特長. . 土壌、環境水から培養液、発酵食品といった 幅広い検体に対応. . DNA抽出からデータ解析までを一式 としたセット価格で提供 (1検体から申し込み可能) [ 細菌は ]データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能. . データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能. セット1:Metagenome@KIN (データベース『RDP』あるいは『テクノスルガ・ラボ 微生物同定データベース』) セット2:QIIME2 (データベース『Greengenes』あるいは『SILVA』) [ 菌類は ]データ解析ソフトウェアは2種類から選択可能. . |biq| vkx| qqt| bkn| gfd| wsg| vmv| nzc| jkj| kzt| kcj| kuj| mvu| yhk| jhd| rmg| mml| xjm| dih| phz| kmm| igj| kaf| glu| igd| onp| unm| wgc| qrv| jnk| lws| mcp| qhs| nrc| spp| mmf| icm| yot| omh| ron| ekt| twz| mgo| djp| tal| dzn| grv| tog| stv| cni|