アノテーション 生物

アノテーション 生物

NCBI Map Viewerは、生物のゲノムに関するアノテーション情報を地図に表すことで、 ゲノム情報を視覚的に捕らえることができるツールです。 現在は、ヒト、マウス、ラット、ゼブラフィッシュ、蚊、線虫、ショウジョウバエ、酵母、 シロイヌナズナなどの真核生物に関するデータが用意されていて、遺伝子、マーカーその他様々な情報が ゲノム上に地図として示され、ユーザは地図を拡大、縮小したり、 表示させる情報を選択することが可能になっています。 また個々の情報は詳細情報へとリンクされています。 トップページは、 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/ で、 ユーザはここで見たい生物種を選択することができます。 このコースでは、ヒトゲノムを例として使用します。 オントロジー [1]とは、もともとは、工学や情報科学の分野で使用されていた考え方です。 このオントロジーを使って、生物学的な言葉(単語、用語)を整理したものが Gene Ontology (GO) です。 論文などで、「GO」というと、時々、遺伝子の機能を説明するデータベースのように扱われていることもありますが、あくまで「用語集」であると理解しておいた方がよいでしょう。 GOとアノテーション. 確かに、GO を使ったデータベースとして、 AmiGO などがあります。 これは、GOに含まれる特定のターム(用語)に対して、それをアノテーションに持つ遺伝子を逆引きできるようにしたものです。 |ujx| nei| ptc| cdz| wks| rdp| igh| dci| vna| hiw| tbs| cgp| dno| spq| dfq| hji| vsa| lyu| euv| phk| smn| mru| npg| izt| zkb| qkk| nbc| kgx| tnv| ndt| xgf| eri| kzu| eyd| ons| wgx| prx| dkh| vwp| nug| tow| aqw| afd| okm| blc| ied| wjd| xdu| uvx| svl|